L’ensemble des acteurs locaux sont associés à la gouvernance de l’ARS et sont représentés dans les instances. Les élus participent au Conseil de surveillance, à la Conférence régionale de santé et de l’autonomie (CRSA), aux commissions de coordination et aux conférences de territoire. Les professionnels de santé et les associations d’usagers sont représentés dans la CRSA et les conférences de territoire.

L’ARS est dotée d’un Conseil de surveillance, d’une Conférence régionale de la santé et de l’Autonomie (CRSA), de commissions de coordination et de conférences de territoire.

Ces instances de coordination et de concertation facilitent la collaboration et le partage des informations avec les acteurs de santé et les représentants des usagers.

• Le Conseil de surveillance est l’instance délibérante de l’ARS. Présidé par le Préfet de région, il approuve le compte financier et émet un avis sur le Plan stratégique régional de santé, le projet de Contrat pluriannuel d’objectifs et de moyens de l’Agence, les résultats de l’action menée par l’Agence.
• La Conférence régionale de la santé et de l’autonomie - CRSA est une instance stratégique de l’ARS, qui conditionne l’avancée du projet régional de santé. Elle émet un avis sur le Plan régional de santé, évalue les conditions dans lesquelles sont appliqués et respectés les droits des malades et des usagers du système de santé.
• Deux commissions de coordination sont animées par l’ARS sur le champ de la prévention,  de la prise en charge et de l’accompagnement médico-social.
• Les Conférences de Territoires permettent de disposer d’un échelon local pour intégrer les réalités de terrain dans la stratégie de l’ARS.

Le Projet régional de santé (PRS), tel que défini par la loi ‘‘Hôpital, patients, santé et territoire’’ s’inscrit dans les orientations de la politique nationale de santé et définit les objectifs pluriannuels de l’Agence Régionale de Santé ainsi que les mesures destinées à les atteindre.

Il vise à déterminer les priorités des politiques de santé en région, dans les différents champs sanitaire, ambulatoire, médico-social et de prévention, au plus près des besoins de la population et donc dans une logique territoriale.